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全球近40項研究匯總,帶你全面了解奧密克戎 焦點短訊
發(fā)布日期: 2022-12-18 10:18:10 來源: 澎湃新聞

三年抗疫已進入新階段。防疫“新十條”發(fā)布后,如何應(yīng)對Omicron(奧密克戎)、適應(yīng)防控新形勢正處于磨合期。自2021年11月在南非首次檢出后,Omicron迅速取代Delta(德爾塔)全球流行,成為優(yōu)勢毒株。迄今,科學(xué)界對Omicron已有哪些了解?Omicron已在自然界和人類社會中占據(jù)了怎樣的位置?近期刊發(fā)的一篇綜述文章匯總了全球近40項有關(guān)Omicron變異株的研究結(jié)果,為奧密克戎進行了多角度的畫像。

該文題為《新型冠狀病毒Omicron變異株病原學(xué)及流行病學(xué)研究進展》,今年11月底刊發(fā)于中華醫(yī)學(xué)會主辦、中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所承辦的《中華流行病學(xué)雜志》。文章作者來自北京大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院、北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部美年公眾健康研究院及北京大學(xué)公眾健康與重大疫情防控戰(zhàn)略研究中心。

該文為認識Omicron提供了豐富證據(jù)。如,關(guān)于 Omicron從哪里來?一項對Omicron變異株起源的研究發(fā)現(xiàn),Omicron變異株的祖先大致于2020年中期由人類傳到家鼠,在家鼠中經(jīng)歷一年多的進化,于2021年底回傳人類。Omicron傳染力有多強?模擬研究顯示,辦公室、餐廳、歌舞廳和公共交通中的大多數(shù)情況都難以通過正確佩戴外科口罩達到對Omicron變異株的有效防護。疫苗能管多久?美國CDC(疾病預(yù)防與控制中心)的數(shù)據(jù)顯示,接種第三劑疫苗5個月后,預(yù)防Omicron變異株的有效性僅為19%。


【資料圖】

作者建議,考慮到我國人口自然感染免疫水平低、人口基數(shù)大、人口老齡化等多種因素,應(yīng)研發(fā)保護效果更好、更持久的疫苗,加大新冠病毒疫苗基礎(chǔ)和序貫加強免疫的覆蓋,提高人群免疫水平;同時關(guān)注重點人群,減少重癥和死亡。

Omicron從哪里來?

該文寫道,一項對Omicron變異株起源的研究發(fā)現(xiàn),Omicron變異株的祖先大致于2020年中期由人類傳到家鼠,在家鼠中經(jīng)歷一年多的進化,于2021年底回傳人類。由此可見,Omicron變異株可從人類傳播到動物宿主,然后再實現(xiàn)從動物到人類的溢出。人群大流行中,新冠病毒由人類傳給動物,受感染動物作為傳染源的意義,值得進一步觀察。

值得注意的是,目前已有來自29個國家的400多種動物感染了新冠病毒,包括寵物、野生動物和家畜等。與原始株和Delta變異株相比,Omicron變異株的宿主范圍更廣。除了原始株的宿主外,Omicron變異株還能與果子貍、嚙齒動物、多種蝙蝠以及一些刺猬的ACE2(angiotensin converting enzyme 2,血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2)受體結(jié)合。

Omicron進化到哪一步了?

B.1.1.529變異株來自B.1.1譜系,為新冠病毒的進化支系之一。 B.1.1.529變異株最早于2021年11月在南非檢出,該變異株具有大量的突變,傳播速度快,WHO根據(jù)新冠病毒進化技術(shù)咨詢小組的建議,將B.1.1.529 列為值得關(guān)切的變異株(variants of concern,VOC),并命名為Omicron變異株。

Omicron持續(xù)變異,不斷出現(xiàn)新的亞型,主要包括BA.1,BA.2,BA.3,BA.4和BA.5亞型及其后代譜系。Omicron變異株不同亞型特征的比較見下表。

Omicron變異株不同亞型特征比較。論文附圖

從新冠病毒基因序列的進化樹來看,BA.1、BA.2和BA.3屬于Omicron變異株不同的進化 分支,而BA.4和BA.5則是在BA.2的基礎(chǔ)上進化而來,由于其遺傳變異的相似性,經(jīng)常把 BA.4和BA.5合并稱為BA.4/5。

與原始株相比,BA.1在刺突蛋白中含有34個突變,這些刺突蛋白突變會引起其病毒學(xué)特征的改變,如復(fù)制能力和毒性降低,傳染力增強。隨后的Omicron變異株亞型均保留這些突 變。

BA.4/5與BA.2相比增加了L452R、F486V和R493Q突變,其中L452R突變是此前Delta變異株的重要突變位點,有利于病毒躲避針對RBD(receptor binding domain,新冠病毒表面刺突蛋白上的受體結(jié)合域)2類和3類區(qū)域的抗體,是導(dǎo)致高免疫逃逸能力的關(guān)鍵突變位點之一。

此外,BA.4/5 攜帶的F486V突變還有利于逃逸針對RBD的1類和2類抗體,R493Q回復(fù)突變又增加了RBD與受體結(jié)合的親和力,進而提高了BA.4/5的適應(yīng)性。

2022年12月15日,鐘南山在“全國高校抗疫大講堂”上的分享截圖。

值得注意的是,由于截稿時間限制,該文并未涉及Omicron變異株BF.7亞型。12月15日下午,中國工程院院士鐘南山在“全國高??挂叽笾v堂”上作“新冠(Omicron)疫情動態(tài)及應(yīng)對”主題分享時表示,當前,北京、保定等地流行的主要為奧密克戎變異株BF.7,廣州、重慶等地主要流行的為奧密克戎變異株BA.5.2。而BF.7是BA.5.2.1.7的簡稱,是在BA.5.2基礎(chǔ)上的突變株,總體來看,兩種毒株沒有明顯的差異。

他解釋,BF.7是在BA.5.2的基礎(chǔ)上增加了一個R346T位點突變,因而有了更強的免疫逃逸,潛伏期進一步縮短,“有人接觸病人后第二天就出現(xiàn)感染,但大部分人感染后一直沒有很明顯高燒,可以說是無癥狀感染,一部分咽干、咽痛、干咳、頭痛、發(fā)熱等,只要不侵犯肺、不缺氧都是輕癥。”

Omicron傳染力有多強?

研究顯示,Omicron變異株傳染力和傳播速度比原始株和其他關(guān)切的變異株(VOC)更強。

新冠病毒原始株、Delta、Omicron變異株的R0(基本再生數(shù),描述病毒傳染力的指標,數(shù)值越大病毒的傳染力越強 )分別為2.2、3.2、9.5,表明傳染力不斷增強。

南非研究顯示,在Omicron變異株主導(dǎo)的疫情期間,病例的增加速度更快,該地區(qū)從首例病例出現(xiàn)到疫情高峰的時間為1個月,而Delta疫情時為2個月。

《新型冠狀病毒肺炎防控方案(第九版)》指出新冠病毒主要為經(jīng)呼吸道飛沫和密切接觸傳播,在相對封閉的環(huán)境中可經(jīng)氣溶膠傳播,接觸被病毒污染的物品后也可能造成感染。

與原始株和其他關(guān)切的變異株(VOC)相比,Omicron變異株更具穩(wěn)定性,室溫下可在物體表面存活更久。發(fā)表于bioRxiv預(yù)印本上的研究表明,在氣溫為25 °C,相對濕度為45%~55%的條件下,Omicron變異株在塑料表面可存活193.5小時,在人體皮膚模型表面可以存活21.1小時,對于原始株則分別為56.0和8.6小時。

此外,在21~22 °C實驗室環(huán)境中,BA.1可在不銹鋼、聚丙烯塑膠片以及玻璃等光滑表面上穩(wěn)定存活超過7天,在面巾紙、打印紙等多孔、凹凸不平的物體表面上,BA.1可保持30分鐘的傳染性。

我國珠海市對Omicron變異株聚集傳播案例的流行病學(xué)調(diào)查顯示,進口假牙和牙膜可能是疫情的源頭;類似地,我國北京市也報告了可能由北美郵寄文件導(dǎo)致的Omicron變異株聚集傳播案例。上述研究均提示Omicron變異株及其亞型極有可能通過非冷鏈污染物體的媒介進行傳播。

一項模型研究揭示了Omicron變異株經(jīng)氣溶膠媒介傳播的風(fēng)險。研究表明Omicron變異株 感染者有更高的病毒載量,加之Omicron變異株更高的傳染性,大大增加了其經(jīng)氣溶膠傳播的風(fēng)險。模擬研究顯示,Omicron變異株感染者中有較高概率排出高濃度的病毒,且辦公室、餐廳、歌舞廳和公共交通中的大多數(shù)情況都難以通過正確佩戴外科口罩達到對Omicron變異株的有效防護。提示氣溶膠這一傳播媒介在Omicron變異株傳播中的重要性,值得關(guān)注和警惕。

作者建議,Omicron變異株傳播方式主要還是通過飛沫傳播,因此,仍應(yīng)堅持規(guī)范佩戴口 罩、保持社交距離、勤洗手、多通風(fēng)的疫情常態(tài)化防控措施,同時需關(guān)注經(jīng)污染物體和氣溶膠媒介傳播的風(fēng)險。

Omicron致病特征是哪些?

人群流行病學(xué)研究表明,Omicron變異株感染后輕癥和無癥狀感染者居多,癥狀持續(xù)時間短,以上呼吸道癥狀為主。

我國浙江省寧波市61例確診的Omicron變異株感染者中,54.1%為無癥狀感染者。我國廣東省珠海市38例確診的Omicron變異株感染者中,76%為輕癥或無癥狀感染者。

英國的一項縱向研究,分別納入Delta和Omicron變異株感染者各4990例。結(jié)果顯示,Omicron變異株感染者癥狀持續(xù)6.87天,明顯小于Delta變異株(8.89天);Omicron變異株感染者的嗅覺喪失比例降低(16.7% vs. 52.7%),腦霧、眩暈和發(fā)熱等使人虛弱的癥狀也明顯減少,但咽喉疼痛風(fēng)險增加(70.5% vs. 60.8%)。

新冠病毒感染急性期后出現(xiàn)的持續(xù)癥狀被稱為“新冠病毒長期癥狀”。英國的一項病例對照研究顯示,Omicron變異株流行期的感染者中4.5%的人報告了新冠病毒長期癥狀,而Delta變異株流行期的感染者中報告新冠病毒長期癥狀的比例是10.8%。進一步調(diào)整多種混雜因素后的分析顯示,感染Omicron變異株后發(fā)生新冠病毒長期癥狀的風(fēng)險比Delta變異株明顯降低。

就疾病結(jié)局來看,在 Omicron變異株流行早期,多項流行病學(xué)研究顯示,Omicron 變異株引起的住院、重癥和死亡風(fēng)險低于先前的變異株。

南非前瞻性隊列研究顯示,在住院患者中,與先前Delta變異株感染者相比,Omicron變異株感染者發(fā)生重癥的概率顯著降低70%(OR=0.3,95%CI:0.2~0.5)。美國回顧性隊列研究顯示,相比Delta變異株,Omicron變異株感染者總體入院風(fēng)險下降41%,其中,入住重癥監(jiān)護室風(fēng)險下降50%,機械通氣風(fēng)險下降64%,死亡風(fēng)險下降79%。上述研究均基于國家性的大型人群數(shù)據(jù)開展,并調(diào)整了年齡、性別、疫苗接種和新冠病毒感染史等可能與疾病嚴重性相關(guān)混雜因素。

對Omicron變異株不同亞型的研究顯示,不同亞型感染導(dǎo)致的疾病嚴重程度無顯著差異。南非研究顯示,BA.4/5感染者在入院和發(fā)展成重癥風(fēng)險方面與BA.2類似。

在病死率方面,研究發(fā)現(xiàn)原始株、Beta、Delta、BA.1 和 BA.4/5變異株的病死率分別為5.3%、 6.9%、6.4%、2.5%和1.9%。與BA.1相比,BA.4/5變異株感染者病死率差異無統(tǒng)計學(xué)意義(HR=1.12,95%CI:0.93~1.34)。

感染新冠病毒后發(fā)展為重癥危險因素包括男性、老年、肥胖、心血管病和呼吸系統(tǒng)疾病等。我國香港地區(qū)Omicron變異株流行期間,對2021年12月31日至2022年9月28日的9943例新冠肺炎死亡病例分析顯示,死者中位年齡為86歲,91%患有長期慢性病,69%未接種過任何疫苗或接種過1劑疫苗但未滿14天,28%未接種疫苗加強針。

作者總結(jié)道,可見,未接種疫苗、老年、合并慢性病為感染Omciron變異株后重癥和死亡的重要危險因素。

疫苗對Omicron效果如何?

Omicron變異株強大的免疫逃逸能力使得突破性感染(完全接種疫苗后發(fā)生的感染)風(fēng)險陡增。

丹麥針對早期785例確診的Omicron變異株感染者的分析顯示,完全接種或者加強接種疫苗的比例為83.1%。我國浙江省163例確診的Omicron變異株感染者(≥60歲)中,57.06%的感染者加強接種了疫苗。高感染率可能與Omicron變異株免疫逃逸增強有關(guān),同時來自疫苗接種和既往感染的保護也在減弱。

多項研究證據(jù)顯示,兩劑滅活疫苗基礎(chǔ)免疫后,針對Omicron變異株產(chǎn)生的體液免疫和細胞免疫應(yīng)答水平較低,加強免疫可提高機體免疫應(yīng)答水平,序貫加強免疫優(yōu)于同源加強免疫。

我國學(xué)者研究顯示,在完成兩劑CoronaVac(科興滅活疫苗)接種3~5周后,針對Omicron 變異株的50%蝕斑減少中和試驗(PRNT50)抗體滴度均低于檢測下限。而兩劑BBIBP-CorV(國藥滅活疫苗)接種第14天時,80%的血清樣本對Omicron變異株的中和抗體滴度都低于檢測下限。

完成第三劑CoronaVac(科興滅活疫苗)加強免疫后,可誘導(dǎo)針對Delta和 Omicron變異株有效的體液免疫、B細胞和T細胞免疫。相比同源加強免疫,使用mRNA疫苗、重組亞單位疫苗異源加強免疫后,針對Omicron變異株的中和活性更優(yōu)。

在滅活疫苗基礎(chǔ)免疫后,mRNA疫苗接種明顯增強針對Omicron變異株的體液免疫和細胞免疫應(yīng)答。特異IgG水平是同源加強免疫的8倍,血漿針對Omicron變異株的90%蝕斑減少中和試驗(PRNT90)抗體滴度水平是同源加強免疫的4倍,RBD特異性記憶B細胞數(shù)量是同源加強免疫的73倍。假病毒中和試驗(pVNT)中,重組亞單位疫苗加強產(chǎn)生的針對 Omicron變異株的血清中和抗體水平是同源滅活疫苗加強的2倍,對Omicron變異株的中和抗體滴度陽性率達到了100%。

人群流行病學(xué)研究表明,現(xiàn)有疫苗基礎(chǔ)免疫預(yù)防Omicron變異株感染或者發(fā)病保護效果較低,但仍可有效防止重癥和死亡,接種加強針可提高對Omicron 變異株保護效果。

基于中國香港地區(qū)BA.2流行期間的研究結(jié)果表明,對20~59歲年齡組人群,兩劑 CoronaVac(科興滅活疫苗)預(yù)防新冠肺炎重癥/死亡的保護效果為91.7%(88.7%~94.0%);對≥60歲年齡組老年人降至69.9%(64.4%~74.6%);三劑CoronaVac(科興滅活疫苗)對新冠肺炎重癥和死亡的保護效果為98.6%(98.0%~99.0%)。

疫苗能管多久?既往感染疊加疫苗效果如何?

針對原始株設(shè)計的新冠病毒疫苗對Omicron變異株感染引起的新冠肺炎的保護效果備受關(guān)注。此外,在當前感染人數(shù)不斷增加的形勢下,既往感染與疫苗的疊加效果如何也是亟待回答的問題。

作者總結(jié)道,疫苗的免疫效果會隨接種時間延長而減弱。荷蘭大型人群病例對照研究顯示,接種第三劑疫苗3個月后對BA.1和BA.2的保護效果明顯下降。美國CDC(疾病預(yù)防與控制中心)的數(shù)據(jù)顯示,接種第三劑疫苗5個月后,預(yù)防Omicron變異株的有效性僅為19%。

美國食品與藥品管理局通過了在新冠病毒加強疫苗中添加Omicron變異株成分的建議,并修改了兩種mRNA疫苗即BNT162b2和mRNA-1273的緊急使用授權(quán),批準針對BA.4/5與原始株的雙價疫苗。經(jīng)過批準的雙價疫苗既包括原始株的mRNA成分(提供預(yù)防新冠肺炎的廣泛保護),也包含BA.4和BA.5變異株共有的mRNA成分(提供預(yù)防Omicron變異株的更好保護)。兩款雙價疫苗均為單一加強接種,在完成基礎(chǔ)免疫或單價疫苗加強后2個月即可接種。單價mRNA疫苗不再被批準用于≥ 12歲個體的加強接種。

疫苗與既往感染疊加的保護效果如何?

既往感染新冠病毒可在一定程度上誘導(dǎo)機體產(chǎn)生針對Omicron變異株的免疫保護,聯(lián)合疫苗接種可對Omicron變異株感染提供更有力的保護。

葡萄牙一項研究顯示,既往感染原始株、Alpha、Delta、BA.1或BA.2變異株均可對BA.5感染提供一定的保護,分別為51.6%、54.8%、61.3%和75.3%。一項血清學(xué)試驗則表明,既往新冠病毒感染者接種1劑BNT162b2疫苗(BioNTech/輝瑞的新冠mRNA疫苗)3~5 周后,產(chǎn)生的針對Omicron變異株的PRNT50抗體滴度為130.0,高于未接種疫苗的既往感染者(77.8)。荷蘭一項病例對照顯示,與任一種情況相比,既往感染疊加疫苗接種可以提供針對BA.1或 BA.2變異株更好的保護效果。

既往免疫與疫苗接種疊加效果更好的原因可能與免疫次數(shù)有關(guān)。研究顯示,個體免疫的次數(shù)(包括自然感染和疫苗接種)越多,機體引發(fā)的中和抗體應(yīng)答水平及廣譜程度(包括針對Omicron變異株的中和抗體反應(yīng))越高,提供的保護效果越好。

作者建議,考慮到我國人口自然感染免疫水平低、人口基數(shù)大、人口老齡化等多種因素,應(yīng)研發(fā)保護效果更好、更持久的疫苗,加大新冠病毒疫苗基礎(chǔ)和序貫加強免疫的覆蓋,提高人群免疫水平;同時關(guān)注重點人群,減少重癥和死亡。

關(guān)鍵詞: 奧密克戎
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